Сюжет игры Splinter Cell Blacklist начинается с того момента, где закончилась предыдущая игра серии с подзаголовком Conviction. Спустя полгода спокойствия правительство Соединенных Штатов Америки получает серьезное заявление от нескольких воинствующих наций. Суть ультиматума достаточно проста и понятна: если демократическая Америка не уберет войска с их земли, то неповиновение и игнорирование заявления обернется для Вашингтона серьезнейшими проблемами.