Несмотря на то, что в Фар Край 2 идея геймплея осталась нетронутой, и игровой процесс по-прежнему предлагает геймеру воевать с противниками, применяя всякое разное вооружение, поменялись декорации, действующие лица, главные злодеи и многое другое. На этот раз Джек Карвер, протагонист предыдущей части Far Cry, ушел в отпуск на неопределенный срок, а на его место пришли восьмеро специально обученных наемников, из которых мы и будем выбирать себе протеже.