В ближайшем будущем внезапный и необъяснимый подъём уровня океана оставил большую часть человеческой цивилизации под водой.Икаруга Нацуки, мальчик, потерявший мать и ногу в результате несчастного случая несколько лет назад, возвращается разочарованным из суровой жизни в большом городе, чтобы найти свой старый сельский дом, наполовину поглощённый водой. Он отправляется на поиски затонувших руин лаборатории его бабушки, чтобы найти клад, который, по слухам, она там оставила. Но то, что он находит, — это не богатство и не драгоценности; это странная девушка, спящая в гробу на дне моря.